Laskennallisen kvanttimekaniikan laskeminen: 4 vaihetta

2024 Kirjoittaja: John Day | [email protected]. Viimeksi muokattu: 2024-01-30 09:01

Kemian ja fysiikan laskennalliset laskelmat voivat paljastaa erittäin mielenkiintoisia ominaisuuksia joillekin näytteille (varsinkin jos niitä muutetaan tietyn alkuperäisen yhdisteen tehokkuuden parantamiseksi). menettelyissä dipolimomentin, epävakauden, sähköstaattisen potentiaalikartan, energiakaavion ja propabilististen reaktiivisuuslaskelmien tekijöiden lisäksi, kun laskennallisten kvanttilaskelmien käyttö lyhentää laboratorioaikaa ja tekee selväksi ja spesifiseksi, onko mahdollisen yhdisteen synteesi elinkelpoinen. taloudellisesti ja ajallisesti sanottuna.

Tarvikkeet

• Kvantti
• Molekyylin mallinnus.
• Molekyylikierrokset Orca Avogadro

Vaihe 1: Laskennallinen kvanttimekaniikan laskenta - Avogadro

Lataa ensin Avogadro, johon on mahdollista syöttää Orca -ohjelmistolla

Avogadro -ohjelmistossa voit taata molekyylien luomisen ja optimoinnin 99,9%: lla; välttääksesi ristiriidat Ctrl + Alt + o -komennon kanssa, mikä puolestaan ei takaa oikeaa molekyylikompressiota käytettäessä Orcan tulolaajennuksia.

Optimoidaksesi molekyylin, luo ensin kiinnostava molekyyli (ilmeisesti) ja napsauta sitten E (huomaa, että tämän E: n alla on nuoli alaspäin), joten vastaava laskelma tulee näkyviin ohjelmiston sisältävän näytön vasempaan yläkulmaan.

Vaihe 2: Ohjelmisto Orca

Kun tämä syöttö on tehty oikein, napsauta laajennukset -välilehteä, viitaten edelleen Avogadro -ohjelmistoon, ja etsi ORCA -vaihtoehto

Napsauta Lisäasetukset, kun syötteen luomisen näyttö avautuu, ja valitse Päivämäärä -vaihtoehto MO ja toinen alla. - JÄTÄ KAKSI MERKKIÄ - saadaksesi elektronitiheyden ja aktivoidut molekyylin orbitaalit Orcan suorittamien kvanttilaskelmien aikana - vain syöttömenettelyt;)

Suorita Perus -välilehden toimenpiteen jälkeen komento:! RHF SP def2-SVP

kirjoita koodi oikein / huolellisesti …

! Normaali tulostus

% lähtö

Tulosta [P_Basis] 2

Tulosta [P_MOs] 1

loppuun

TIEDOT, lataa ja asenna Orca tietokoneellesi ennen tällaisen toimenpiteen suorittamista!

Kun olet suorittanut yllä olevat komennot, napsauta Luo ja tallenna tällainen tiedosto. Kirjoita kansioon, johon Orca on asennettu. (Esimerkki: Asensin Orcan tietokoneen C -asemaan -> tallenna tiedosto tietokoneen C -aseman sisälle Orca -kansioon).

Vaihe 3: Cmd -ajossa…

Avaa cmd ja kirjoita:

cd C: / Orca; Orca -ohjelmisto on asennettu tietokoneesi C -asemaan… ja paina enter.

Näet tämän osan kuvan kaltaisen näytön tällaisen toimenpiteen jälkeen, huomaa, onko komento oikea skriptillä C: / Orca> Jos tämä komento on oikea, kirjoita komento plusmerkin eteen (>):

orca.exe (Orca -kansioon tallentamasi molekyylin nimi).inp> (Orca -kansioon tallentamasi molekyylin nimi).out

YKSITYISKOHTAINEN - KOMENTOON EI OLE SUHDESTA JA VAIN MOLEKULAN NIMI

Paina sen jälkeen Enter -näppäintä ja odota… Minun tapauksessani unohdin komennon useita kertoja, koska siihen liittyvä kertolasku on pariton arvo ja elektronien lukumäärä on myös pariton, jos näin tapahtuu, muuta kertolaskuarvoksi 2 edellisessä vaiheessa Basic (in Avogadro -ohjelmisto).

Vaihe 4: Odota minuutti…

Kun komento on annettu, etsi alleviivaus cmd: n seuraavalta komentoriviltä

jos on, WONDER, jatkuu… Odota hetki, kunnes komentosarjan termi tulee näkyviin:

cd: / Orca_

Varmistaaksesi, että.out -tiedostosi on luotu Orca -asennuskansioon, johon Avogadrossa luotu syötetiedosto on tallennettu.

Kun laskenta on suoritettu cmd: llä Orcassa, etsi.out -tiedosto Orca -kansiosta. Tällä hetkellä voit sulkea molekyylin (Avogadro) ja cmd, lopulta kvanttilaskenta on jo tehty …

Avaa seuraavassa vaiheessa Avogadro uudelleen ja etsi avoimesta välilehdestä luotu.out -tiedosto ja avaa se; näet, että molekyyli on HOMO- ja LUMO -kiertorata -arvojen vieressä, vedä välilehteä hieman alaspäin ja näet, että on olemassa laskelmia kiertoradille, jotka antavat noin 100% optimoinnin, kuten kuva paljastaa.

…ja pidä hauskaa…